AVITI i AVITI24
Firma Element Bioscience wprowadziła na rynek system AVITI, z opatentowaną, innowacyjną technologią, która umożliwia sekwencjonowanie najwyższej jakości jednocześnie oferując użytkownikom optymalizację kosztów procedury.
System AVITI
Platforma do sekwencjonowania – AVITI™ – zapewnia najnowocześniejszą technologię sekwencjonowania, elastyczność i niezrównaną wydajność. Sekwencjonowanie odbywa się w technologii „ABC” – Avidity Base Chemistry, w którym proces amplifikacji zachodzi na zasadzie „toczącego koła” (ang. Rolling Circle Amplification – RCA). Dzięki temu replikacji poddawana jest jedynie oryginalna nić DNA, co redukuje ilość błędów, zachodzących podczas amplifikacji. Wykorzystując unikalną kombinację procesów enzymatycznych i chemicznych, ABC zwiększa specyficzność i czułość rozpoznawania zasad, co skutkuje wysoką wiernością danych sekwencjonowania przy minimalnych błędach.
System AVITI składa się z dwóch niezależnych komór, oferując 2 sekwenatory w jednym.
Sytem AVITI zapewnia:
- Oszczędność czasu i kosztów
- Technologia Dual Flow Cell – możliwość wykonania dwóch różnych, niezależnych badań, dzięki możliwości obsługi jednocześnie dwóch niezależnych od siebie flow celi z możliwością załadowania ich w różnym czasie (random acces)
- Dodatkowa funkcja Indywidualnie Adresowanych Linii (IAL) pozwala również na załadowanie 2 puli różnych bibliotek na jeden flow cell i odczyt danych z dwóch różnych linii.
- Nowe zestawy Trinity, skracające workflow pracy z bibliotekami panelowymi o 4-5h (https://www.elementbiosciences.com/trinity)
- Możliwość wyboru modelu „AVITI LT” o niższej cenie, dla aplikacji wymagających mniejszego outputu danych.
- Wiarygodne wyniki
- Dzięki technologii ABC, opartej na awidytach, która zwiększa specyficzność i czułość rozpoznawania zasad i redukuje ilość błędów. Dokładność odczytu Q30: >90% uzyskiwanych danych.
- Możliwość zwiększenia czułości poprzez zastosowanie nowej linii odczynników UltraQ (Q40: >90%; Q50: >70)
- Elastyczność
- Instrument kompatybilny z 3 rodzajami flow cell: niskoprzepustowe, średnioprzepustowe oraz wysokoprzepustowe.
- Zmienna długość odczytu 2×75 bp 2×150 bp 2x 300 bp.
- Instrument występuje również w wersji AVITI LT, która obsługuje flow celle low i medium output, z możliwością upgradu do pełnej wersji
- Oszczędność kosztów – innowacyjna technologia ABC, pozwoliła firmie Element znacznie zredukować koszty sekwencjonowania, poprzez eliminację chemii fluorescencyjnej stosowanej w przypadku znakowania każdej z zasad w technologii SBS oraz zredukowanie kosztów produkcji odczynników, co skutkuje znacznie niższym kosztem na próbkę.
- Szerokie możliwości badawcze – możliwość rozbudowy instrumentu o funkcje cytoprofilowania (AVITI 24 – NOWOŚĆ)
System AVITI 24 – Nowa Generacja Badań Pojedynczych Komórek
AVITI24 to pierwsza platforma laboratoryjna umożliwiająca wysokiej jakości sekwencjonowanie i multiomikę in situ w jednym systemie. Od sekwencjonowania genomu, eksomu po proteomikę przestrzenną, AVITI24 umożliwia nieograniczone możliwości innowacyjnych badań na jednej, zintegrowanej platformie.
Dzięki AVITI 24 można jednocześnie sekwencjonować, wizualizować RNA, białka i morfologię komórek w rozdzielczości przestrzennej pojedynczej komórki.
System ma 4 główne funkcje:
- Sekwencjonowanie Nowej Generacji oparte na technologii awidytów (ABC – Avidate Base Chemistry) zapewniające najwyższą dokładność odczytów
- Wizualizację morfotycznych cech pojedynczych komórek – możliwość obrazowania błony komórkowej oraz poszczególnych organelli (jądro komórkowe, mitochondria, aparat Golgiego, retikulum endoplazmatyczne), pozwalając na ocenę morfologii komórki, np. w odpowiedzi na leki lub w postępie choroby, czy badaniach cytotoksyczności)
- Detekcja RNA – profilowanie do 350 transkryptów z rozdzielczością przestrzenną, profilowanie zmian ekspresji genów w pojedynczych komórkach. Ukierunkowane panele RNA Teton, skoncentrowane na apoptozie MAPK i szlakach sygnalizacji komórkowej, immunologii* i neurologii*, umożliwiają badaczom analizowanie typów i stanów komórek oraz szlaków sygnalizacyjnych z wysoką rozdzielczością w dziesiątkach tysięcy do miliona komórek na próbkę (*panele immunologiczne i neurologiczne dostępne w 2025 roku)
- Detekcja białek – panele Teton dla ukierunkowanych białek umożliwiają profilowanie do 50 niefosforylowanych i fosforylowanych białek w jednej próbce